Ճապոնիայում հայերը գործունեություն են ծավալել 19-րդ դարի երկրորդ կեսից: Այնտեղ հիմնականում հաստատվել են Հնդկաստանի հայեր, որոնք զբաղվել են ծովագնացային առևտրով: 20-րդ դարում հայ առևտրականների թիվը Ճապոնիայում ավելացել է Մերձավոր Արևելքից, մասնավորապես՝ Իրանից, Սիրիայից և Լիբանանից գաղթած հայ ընտանիքների հաշվին: